多数据库文献检索
文献深度分析
跨文献综合分析
数据可视化
微生物-疾病-代谢物关联网络
研究质量评估
对已分析文献进行多维度研究质量评估，包括方法学问题、机制深度、临床转化等。
创新研究方向
识别研究空白，生成具有科学问题、假设机制和可行实验设计的创新方向。
综合研究空白分析
全面分析领域研究空白，包含证据强度感知和反证分析。
审稿人评估报告
模拟 Nature / Cell / Gut 审稿人视角，审视过度推断、逻辑跳跃和方法学缺陷。
生物信息学分析 (scikit-bio)
Alpha + Beta 多样性分析
基于文献共现模式构建丰度矩阵，计算多样性和距离指标。注意：分析单位为"文献"而非"生物样本"，反映的是文献共现模式。
PCoA 主坐标分析
基于 Bray-Curtis 距离矩阵进行 PCoA 降维，可视化样本间群落结构差异。
组间差异检验
按证据强度分组，检验不同组间微生物群落结构是否存在显著差异。PERMANOVA 检验组间均值差异，ANOSIM 检验组间相似性（两者互补）。
进化树构建
基于微生物共现距离矩阵，使用 Neighbor-Joining 方法构建系统发育树。